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深圳市艾斯基因科技有限公司
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DNA 6mA免疫沉淀測序 (6mA-IP Seq)

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6mA免疫沉淀測序(6mA-IP Seq)通過特異性抗體富集6mA甲基化的DNA片段,結(jié)合NGS測序技術(shù)在全基因組水平上分析6mA修飾信息。
產(chǎn)品介紹

DNA 6mA免疫沉淀測序(6mA-IP Seq)

N6-甲基脫氧腺苷(6mA)是原核生物和真核生物的DNA修飾類型之一,

在細菌、藻類及植物基因組中普遍存在,在DNA錯配修復(fù)、染色體分離和毒力調(diào)節(jié)中發(fā)揮作用。

6mA免疫沉淀測序(6mA-IP Seq)通過特異性抗體富集6mA甲基化的DNA片段,結(jié)合NGS測序技術(shù)在全基因組水平上分析6mA修飾信息。

用心服務(wù)每一個項目

專注表觀組學(xué)10年,提供專業(yè)有價值的DNA甲基化完整解決方案;

國內(nèi)較早開發(fā)6mA-seq技術(shù)團隊之一, 嚴(yán)格的內(nèi)參質(zhì)控;

已經(jīng)完成藻類及動植物及人等多個物種6mA-seq項目經(jīng)驗;

專業(yè)的生物信息分析團隊, 提供更多個性化分析思路和方案。

科學(xué)方案設(shè)計

從項目方案、樣本處理、建庫測序,到數(shù)據(jù)分析;

每個項目需要專業(yè)、有價值的建議;及時高效的溝通,以保障高質(zhì)量研究成果。

樣本類型和要求

樣本類型

樣本要求

基因組DNA

總量≥ 5ug; 濃度≥ 50ng/ul; 基于Qubit定量

動植物、藻類、低等生物等

按照送樣要求準(zhǔn)備

備注:用封口膜密封樣品; 干冰運輸

數(shù)據(jù)分析

6mA-IP Seq

分析內(nèi)容

備注

標(biāo)準(zhǔn)分析

1、測序數(shù)據(jù)質(zhì)量評估

過濾掉低質(zhì)量數(shù)據(jù),保證數(shù)據(jù)質(zhì)量

2、與參考基因組比對

測序Reads 在基因組上的分布

3、6mAPeak峰Calling

6mADNA富集區(qū)域鑒定

4、6mAPeak圖譜分析

6mAPeak在基因組,染色體,功能元件上的分布

6、組間差異6mAPeak分析

尋找6mADMR及注釋

7、差異6mAPeak基因分析

相關(guān)基因GO,KEGG富集分析

高級分析

8、多組學(xué)整合關(guān)聯(lián)分析

例如與轉(zhuǎn)錄組關(guān)聯(lián)分析

9、其它定制化分析

結(jié)合課題背景亮點挖掘

DNA 6mA免疫沉淀測序 (6mA-IP Seq)

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DNA 6mA免疫沉淀測序(6mA-IP Seq)

N6-甲基脫氧腺苷(6mA)是原核生物和真核生物的DNA修飾類型之一,

在細菌、藻類及植物基因組中普遍存在,在DNA錯配修復(fù)、染色體分離和毒力調(diào)節(jié)中發(fā)揮作用。

6mA免疫沉淀測序(6mA-IP Seq)通過特異性抗體富集6mA甲基化的DNA片段,結(jié)合NGS測序技術(shù)在全基因組水平上分析6mA修飾信息。

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專注表觀組學(xué)10年,提供專業(yè)有價值的DNA甲基化完整解決方案;

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已經(jīng)完成藻類及動植物及人等多個物種6mA-seq項目經(jīng)驗;

專業(yè)的生物信息分析團隊, 提供更多個性化分析思路和方案。

科學(xué)方案設(shè)計

從項目方案、樣本處理、建庫測序,到數(shù)據(jù)分析;

每個項目需要專業(yè)、有價值的建議;及時高效的溝通,以保障高質(zhì)量研究成果。

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樣本要求

基因組DNA

總量≥ 5ug; 濃度≥ 50ng/ul; 基于Qubit定量

動植物、藻類、低等生物等

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6mA-IP Seq

分析內(nèi)容

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標(biāo)準(zhǔn)分析

1、測序數(shù)據(jù)質(zhì)量評估

過濾掉低質(zhì)量數(shù)據(jù),保證數(shù)據(jù)質(zhì)量

2、與參考基因組比對

測序Reads 在基因組上的分布

3、6mAPeak峰Calling

6mADNA富集區(qū)域鑒定

4、6mAPeak圖譜分析

6mAPeak在基因組,染色體,功能元件上的分布

6、組間差異6mAPeak分析

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7、差異6mAPeak基因分析

相關(guān)基因GO,KEGG富集分析

高級分析

8、多組學(xué)整合關(guān)聯(lián)分析

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