ChIP富集DNA

總量≥ 1ng; 濃度≥ 0.1ng/ul; 基于Qubit定量；主峰范圍在100-750bp;

細(xì)胞沉淀

組蛋白修飾1x10*7細(xì)胞；轉(zhuǎn)錄因子5x10*7細(xì)胞

動(dòng)植物組織

按照送樣要求準(zhǔn)備

備注：用封口膜密封樣品; 干冰運(yùn)輸

標(biāo)準(zhǔn)化分析

1、測(cè)序數(shù)據(jù)質(zhì)量評(píng)估

去除低質(zhì)量數(shù)據(jù)及接頭序列

2、與參考基因組比對(duì)

測(cè)序reads 在基因組上的分布

3、Peak峰Calling

尋找組蛋白修飾或者轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn)

4、Motif分析

尋找修飾或者結(jié)合序列的偏好性

5、Peak圖譜分析

Peak 在基因組，染色體，功能元件上的分布

6、Peak相關(guān)基因注釋

尋找修飾或者轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合基因

7、組間差異Peak分析

尋找差異修飾或者轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合區(qū)域

8、差異Peak基因分析

相關(guān)基因GO，KEGG富集分析

高級(jí)分析

9、多組學(xué)整合關(guān)聯(lián)分析

例如,與轉(zhuǎn)錄組等數(shù)據(jù)關(guān)聯(lián)分析

10、其它定制化分析

結(jié)合課題背景亮點(diǎn)挖掘