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包含了原450K芯片91%的位點，又增加了413,745個位點(總共853,307個CpG位點)產(chǎn)品介紹Illumina甲基化芯片Infinium MethylationEPIC BeadChip(簡稱850K甲基化芯片)，
在原450K芯片的基礎(chǔ)上，推出了新一代的DNA甲基化芯片;
包含了原450K芯片91%的位點，又增加了413,745個位點(總共853,307個CpG位點);
850K芯片覆蓋基因啟動子區(qū)、基因編碼區(qū)、CpG島以及增強子區(qū);
普遍用于復(fù)雜疾病甲基化研究，以及大樣本EWAS研究的。
850K芯片技術(shù)參數(shù)
針對人基因組，檢測853,307個CpG位點，覆蓋CpG島、啟動子、編碼區(qū)、開放染色質(zhì)和增強子;
同時采用Infinium I及II探針設(shè)計，使檢測范圍更大化;
單堿基分辨率，可以直接檢測到發(fā)生甲基化的確切位點;
重復(fù)性較高，技術(shù)重復(fù)相關(guān)性以及與450K相同探針間的相關(guān)性R2 > 0.98;
起始模板量低，只需 250ng;適用于FFPE樣本。
樣本類型和要求
樣本類型
樣本要求
人基因組DNA
總量≥ 2ug; 濃度≥ 30ng/ul; 基于Qubit定量
細(xì)胞、全血、新鮮冷凍組織等
按照送樣要求準(zhǔn)備
備注：用封口膜密封樣品; 干冰運輸
信息分析
850K芯片
分析內(nèi)容
標(biāo)準(zhǔn)分析
1．原始數(shù)據(jù)預(yù)處理
2．?dāng)?shù)據(jù)歸一化（甲基化位點總表，含注釋信息)
3．QC結(jié)果（beta值密度曲線，聚類圖，PCA圖，相關(guān)性圖）
4．差異甲基化位點（含注釋信息）
5．差異甲基化位點的染色體分布
6．差異甲基化位點的基因功能注釋與富集
7．差異甲基化位點的熱圖展示
高級分析
8、特定基因組區(qū)段的DMR展示
9、甲基化與轉(zhuǎn)錄的關(guān)聯(lián)分析
10、其它定制化分析
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850K芯片技術(shù)參數(shù)
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同時采用Infinium I及II探針設(shè)計，使檢測范圍更大化;
單堿基分辨率，可以直接檢測到發(fā)生甲基化的確切位點;
重復(fù)性較高，技術(shù)重復(fù)相關(guān)性以及與450K相同探針間的相關(guān)性R2 > 0.98;
起始模板量低，只需 250ng;適用于FFPE樣本。
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總量≥ 2ug; 濃度≥ 30ng/ul; 基于Qubit定量
細(xì)胞、全血、新鮮冷凍組織等
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備注：用封口膜密封樣品; 干冰運輸
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分析內(nèi)容
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1．原始數(shù)據(jù)預(yù)處理
2．?dāng)?shù)據(jù)歸一化（甲基化位點總表，含注釋信息)
3．QC結(jié)果（beta值密度曲線，聚類圖，PCA圖，相關(guān)性圖）
4．差異甲基化位點（含注釋信息）
5．差異甲基化位點的染色體分布
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