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采用甲基化DNA免疫共沉淀技術(shù)，通過5'-甲基胞嘧啶(5mC)抗體特異性富集基因組上發(fā)生甲基化的DNA片段測(cè)序產(chǎn)品介紹甲基化DNA免疫沉淀測(cè)序(Methylated DNA Immunoprecipitation Sequencing，MeDIP-Seq)，
采用甲基化DNA免疫共沉淀技術(shù)，通過5'-甲基胞嘧啶(5mC)抗體特異性富集基因組上發(fā)生甲基化的DNA片段測(cè)序，
可以在全基因組水平上進(jìn)行高精度的CpG密集的高甲基化區(qū)域研究，
是分析基因組DNA甲基化變化的一種準(zhǔn)確可靠的技術(shù)。
用心服務(wù)每一個(gè)項(xiàng)目
艾斯團(tuán)隊(duì)專注表觀組學(xué)10年，提供專業(yè)有價(jià)值的DNA甲基化完整解決方案;
最早開發(fā)MeDIP-seq技術(shù)團(tuán)隊(duì)之一, 嚴(yán)格的內(nèi)參質(zhì)控;
已經(jīng)完成人、小鼠、大鼠、豬等多個(gè)物種MeDIP-seq項(xiàng)目經(jīng)驗(yàn);
核心團(tuán)隊(duì)在Nature communications, Genome biology等雜志發(fā)表多篇SCI論文;
專業(yè)的生物信息分析團(tuán)隊(duì), 提供更多個(gè)性化分析思路和方案。
科學(xué)方案設(shè)計(jì)
從項(xiàng)目方案、樣本處理、建庫(kù)測(cè)序，到數(shù)據(jù)分析;
每個(gè)項(xiàng)目需要專業(yè)、有價(jià)值的建議;及時(shí)高效的溝通，以保障高質(zhì)量研究成果。
樣本類型和要求
樣本類型/文庫(kù)類型
樣本要求
基因組DNA (TAB-WGBS)
總量≥ 3ug; 濃度≥ 30ng/ul; 基于Qubit定量
基因組DNA (TAB-RRBS)
總量≥ 1ug; 濃度≥ 30ng/ul; 基于Qubit定量
細(xì)胞、全血、新鮮冷凍組織等
按照送樣要求準(zhǔn)備
備注：用封口膜密封樣品; 干冰運(yùn)輸
信息分析
TAB-seq
分析內(nèi)容
備注
標(biāo)準(zhǔn)分析
1、測(cè)序數(shù)據(jù)質(zhì)量評(píng)估
過濾掉低質(zhì)量數(shù)據(jù)，保證數(shù)據(jù)質(zhì)量
2、氧化率及亞硫酸鹽轉(zhuǎn)化率評(píng)估
通過內(nèi)參進(jìn)行質(zhì)控文庫(kù)
3、與參考基因組比對(duì)
比對(duì)率和覆蓋度分析
4、5hmC位點(diǎn)Calling
評(píng)估胞嘧啶甲基化狀態(tài)
5、5hmC圖譜分析
5hmC在基因組、功能元件上的分布
6、組間差異DhMR分析
尋找DhMR及注釋
7、差異5hmC基因分析
DMG富集分析GO，KEGG
8、多樣本聚類分析
PCA分析多樣本5hmC變化規(guī)律
高級(jí)分析
9、多組學(xué)整合關(guān)聯(lián)分析
例如與轉(zhuǎn)錄組關(guān)聯(lián)分析
10、其它定制化分析
結(jié)合課題背景亮點(diǎn)挖掘
產(chǎn)品介紹甲基化DNA免疫沉淀測(cè)序(Methylated DNA Immunoprecipitation Sequencing，MeDIP-Seq)，
采用甲基化DNA免疫共沉淀技術(shù)，通過5'-甲基胞嘧啶(5mC)抗體特異性富集基因組上發(fā)生甲基化的DNA片段測(cè)序，
可以在全基因組水平上進(jìn)行高精度的CpG密集的高甲基化區(qū)域研究，
是分析基因組DNA甲基化變化的一種準(zhǔn)確可靠的技術(shù)。
用心服務(wù)每一個(gè)項(xiàng)目
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專業(yè)的生物信息分析團(tuán)隊(duì), 提供更多個(gè)性化分析思路和方案。
科學(xué)方案設(shè)計(jì)
從項(xiàng)目方案、樣本處理、建庫(kù)測(cè)序，到數(shù)據(jù)分析;
每個(gè)項(xiàng)目需要專業(yè)、有價(jià)值的建議;及時(shí)高效的溝通，以保障高質(zhì)量研究成果。
樣本類型和要求
樣本類型/文庫(kù)類型
樣本要求
基因組DNA (TAB-WGBS)
總量≥ 3ug; 濃度≥ 30ng/ul; 基于Qubit定量
基因組DNA (TAB-RRBS)
總量≥ 1ug; 濃度≥ 30ng/ul; 基于Qubit定量
細(xì)胞、全血、新鮮冷凍組織等
按照送樣要求準(zhǔn)備
備注：用封口膜密封樣品; 干冰運(yùn)輸
信息分析
TAB-seq
分析內(nèi)容
備注
標(biāo)準(zhǔn)分析
1、測(cè)序數(shù)據(jù)質(zhì)量評(píng)估
過濾掉低質(zhì)量數(shù)據(jù)，保證數(shù)據(jù)質(zhì)量
2、氧化率及亞硫酸鹽轉(zhuǎn)化率評(píng)估
通過內(nèi)參進(jìn)行質(zhì)控文庫(kù)
3、與參考基因組比對(duì)
比對(duì)率和覆蓋度分析
4、5hmC位點(diǎn)Calling
評(píng)估胞嘧啶甲基化狀態(tài)
5、5hmC圖譜分析
5hmC在基因組、功能元件上的分布
6、組間差異DhMR分析
尋找DhMR及注釋
7、差異5hmC基因分析
DMG富集分析GO，KEGG
8、多樣本聚類分析
PCA分析多樣本5hmC變化規(guī)律
高級(jí)分析
9、多組學(xué)整合關(guān)聯(lián)分析
例如與轉(zhuǎn)錄組關(guān)聯(lián)分析
10、其它定制化分析
結(jié)合課題背景亮點(diǎn)挖掘
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