靶向甲基化測序技術的發展起源

　　靶向甲基化測序起源于1984年，那時候Church和Gilbert開發設計了一種單核苷酸屏幕分辨率的基因組DNA甲基化測序分析計劃方案。Maxam和Gilbert運用肼(N2H4)與未甲基化(高反應性)和甲基化(低反應性)胞嘧啶的差別反應性，在胞嘧啶帶中獲得可辨別數據信號，這種數據信號能夠進一步轉化成甲基化水準。亞硫酸鹽轉換的基因組DNA非常適合Sanger有機化學，所以在20世際90時代，亞硫酸鹽測序(DNA甲基化分析“金標準”)發展趨勢推動了甲基化測序的創新，有關技術自2005年已經商業化的。2007年，根據亞硫酸鹽的焦磷酸測序(一種生成測序方式)根據釋放出來焦磷酸轉換，定量分析檢測核糖核苷酸摻加成正比例數據信號的即時轉換。很多表面基因組新項目，如人們表面基因組方案(HEP，源于2000年)和NAME21試驗(NationalMethylome21.源于2005年)，巨大優化了甲基化測序分析技術。在其中RRBS是一個典型性技術。

　　與靶向甲基化測序(Sanger測序或毛細 血管測序)對比，下一代測序(NGS)(二代測序)服務平臺的研發，如Roche454、Illumina和AppliedBiosystems，從源頭上影響了基因組學中的甲基化分析方式。NGS平臺根據復 制增加與空間分開的DNA模版或流式細胞術(FCM)分開的單獨DNA分子，能夠實現單堿基對屏幕分辨率中的DNA甲基化分析。但NGS的一個關鍵警示是降低了對規模性生物信息學的讀長規定。

　　為防止在增加的DNA 片段生成環節中慢慢喪失同歩reads并確保read品質，NGS技術大大縮短了讀長。讀長的減少必須生物特征計算出來的類似研討式，可能提升拼裝誤差。根據單獨DNA分子編碼序列reads，已經積極主動開發設計第三代測序(Long-readsequencing,長讀長測序)的新DNA甲基化分析方式。根據NGS技術的甲基化分析中，因為長DNA分子的劃分，甲基化數據的很長方式遺失。第三代測序運用別的堿基對的5mC與眾不同數據信號，能夠實時監測長讀長單分子的DNA甲基化。